煮蛋白加wsabuf buffer偏移量的量怎么算

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蛋白纯化问题,希望大家给我支支招,成分感谢
我的蛋白70多KD,上清表达,表达量还可以,在C端加了6His标签,用生工的Ni柱填料挂柱纯化,洗脱后,洗脱液中无目的蛋白,只有杂蛋白,目的蛋白在流穿液当中,说明没挂上,(平衡缓冲液pH8.0,蛋白的等电点4.6左右,上样流速尝试过0.4和0.5ml/min),由于没挂上,打算用切非变性胶的方式纯化,来做后续实验,但将切下的胶电透浓缩后,跑SDS-PAGE分析,有很多杂带,目的条带的量也少,与杂带量差不多,在切的过程中,有时候还切不到自己的目的蛋白,怎么办呀,我已经就纯化蛋白这个问题做了很久了,还没啥进展,希望各位有经验的亲给我一些建议,谢谢谢谢........无数个谢谢。
你可以把你的蛋白做个50kd蛋白得超滤后,用8&&mol尿素变性,在过镍柱试试。
谢谢你的建议,不过换其他tag,我的需要从合成引物开始,因为之前由于考虑到其他实验,所以我引物的酶切位点和其他载体不兼容,所以这个方法可能留在最后尝试了
左边是Marker,中间是空载,右边粗的那条带是表达的蛋白,从图上看说明是表达了的,挂柱的图当时由于想着没挂上,就忘拍了,所以图就不能上传了
你说的那个NaCl&&可能我没表达清楚哈
蛋白有盐溶盐析作用,一定浓度的NaCl可以增加蛋白的可溶度,减少蛋白与蛋白之间的非特异性相互作用,只有浓度很高的时候才会促使蛋白沉淀
如果Tris应该只有盐酸调PH,你说盐酸和NaCl调ph没看太懂,一般过镍柱加300~500mM NaCl比较合适
如果解决不了,看你实验室配置吧 不行就用离子交换先纯化下,然后过个分子筛看你蛋白natural 状态下分子量是多少就知道有没有聚合了
关于你说的非变性胶电透回收,想了解下,跑sds-page你蛋白时你蛋白是没有了 还是变成其它的小分子量的蛋白了呢?
nemo88同学说的有道理,楼主可以参考一下。
首先,用histag蛋白阳性对照确认你的ni柱work。
然后,在buffer中添加变性剂如尿素(可先试一下高浓度尿素以确认确实work),打开蛋白质内部可能包裹的histag。(注:如果histag被包裹在蛋白立体结构内部而无法与ni接触,尿素可以破坏氢键从而暴露内部结构)
最后,还不行的话,用histag抗体做个western,看看你SDS-PAGE胶上的条带中是否存在带histag的蛋白。
祝你好运!
我打错了,是用HCl调,不小心加多了,就用NaoH调,跑SDS-PAGE之后有我的目的蛋白,也有6条其他小分子量的杂蛋白
谢谢,但有一个问题,就是我想获得的蛋白尽量维持天然的结构,用尿素变性之后还能复性到原来的结构吗
额& &为嘛用氢氧化钠?调过了?^_^
有么有试过电透回收后的蛋白放几天再制备次样品,跑个sds-page同时点上前几天的样品做对照& &看看目的蛋白有没有变少、、、
呵呵,是调过了,没有试过放几天再跑,因为回收后的蛋白量很少,放几天的话,很可能降解得看不到了,所以没做
所以你觉着你的蛋白会降解了?那最好还是确定过柱时是否发生了降解,掉了histag
我重新挂了一次柱,改变了一样上样方法,就是把样和填料结合了8个小时,再放出来,再用流穿液继续上样,但出现很奇怪的结果,左边是上样前(粗的那条是目的条带),中间是流穿液第1次和第2次的,最右边直接用500mM咪唑洗脱的,洗脱液中,目的条带上面居然多出一条带,我用的填料是新的,一次也没用过。
离子交换我们实验室都没做过,所以不知道怎么做
N端和C端都有功能区,C端离功能区远点,所以在C端设计的,弱弱地问一句,怎么在His之前加6个Gly,用的histag是载体本身自带的
依次点突变环P,很快就OK了。
或者看在引物里面加对应密码子
这个方法感觉好高大上啊,我不会做,我们实验室有做点突变的,但往往突变的都不是自己希望突变的那个,所以这个依次点突变对我而已无从下手,咋做的哟?但也很感谢你给我的建议
有his标签的蛋白不一定亲和就能成功,可能与蛋白本身有关。离交换很好操作,你的蛋白等电点4点几,溶液ph为8,那么此时蛋白带负电荷,选择阴离子交换,目标蛋白结合在填料上,用高盐进行洗脱。具体操作可以参GE公司的离子交换操作手册。如果你没有我可以发给你。
看来是确实不挂柱子,要想找原因,一个是确定基因序列没有移码确定表达成了his还是表达成了别的氨基酸,另一个就是westrn检测histag是否还在
或者就像前面朋友说的多加点尿素,直接变性,先不用担心复性的问题,先把这个问题解决,复性是有方法的只是可能要摸索下
咪唑直接洗脱多了一条带这个也不好说是多出来的,因为亲和柱属于富集型的柱子,举个栗子,有个蛋白浓度比较低,在你样品中量被稀释了跑电泳可能看不清,但是全部挂到柱子上,那洗脱的时候就相当于被浓缩到你的洗脱液里面,跑电泳就可能看出来了&&这也是有可能的
这个是我以前做的&&左1是破碎完样品 左二离心过滤后样品&&左三流穿 然后是洗脱的&&想说明有些条带变浓是正常的&&
如果被这个问题整的烦,有离子交换的 可以尝试离子交换
从引物上面加
:DMarker跑的很漂亮,赞一个。
谢谢您的回复,目前我的问题已经解决了,谢谢大家的关注
没事 解决就好啦~
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【求助】蛋白加loading buffer煮后有沉淀,电泳条带弯曲,样品中300mM NaCl,算不算高盐?
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这个帖子发布于2年零131天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
同上,提的胰腺组织蛋白,按说明书用的2*细胞裂解液(NaCl浓度300mM),提的蛋白浓度很高。蛋白+裂解液稀释+5*loading buffer煮沸5min后,有少量不溶颗粒样物存在,而且-80度冻存后再取出跑电泳时,不溶颗粒更加明显,离心能离下去好多,电泳跑出的条带不是波浪形就是断断续续,有时还跑不出来,marker跑的很好,想来应该不是胶的问题。想请教一下是不是样品盐离子高的原因?因为我的胰岛细胞用1*细胞裂解液(NaCl浓度150mM)提蛋白就没有这种现象,条带很清晰。实在困惑,做了1个多月western也没什么结果,着实着急。请各位前辈不吝赐教!万分感激!
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开始提取蛋白煮之前不就应该离心取上清液,怎么煮过之后又会有沉淀?
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蛋白浓度稀释到8ug/ul以下。不解释。
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wenshl2005 蛋白浓度稀释到8ug/ul以下。不解释。请问,我的目的蛋白表达量很低,提出来的总蛋白大于30mg/ml,但是目的条带仍然很低!这种情况怎么办?之前出现的问题是条带连成一条线,后来只好隔孔加样,稀释蛋白后会好些,可是目的就惨淡了,请问战友有什么好的建议吗,不胜感激!
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上样时样品中的SDS必须完全溶解 样品用振子混匀
不然每次趋势都不一样
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这个的确是个问题呀。稀释之后浓度下降对于表达量不高的蛋白比较难检出。
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蛋白总量浓度过大加loadingbuffer是会沉淀,你的盐浓度不高,不知道你实验目的是啥,看能不能做个co-ip,如果不想稀释的话。
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怎么根据蛋白量加lodding buffer
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怎么根据蛋白量加lodding buffer
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我们实验室是根据蛋白浓度(BCA法测量)算好蛋白质的上样量,然后加SDS loading buffer 补充成30uL即可。
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先用BCA法测定蛋白浓度,根据浓度算出上样量,根据上样量的四分之一,加入5*的loading buffer
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我们这边也是用bca测蛋白哦浓度的,然后根据浓度算出上样量,一般是所有上样量中最大的上样量除以几成的buffer,比如上样量是18,buffer是六成的,那就加3微升的buffer
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loading buffer都是根据上样体积确定添加量的,最终电泳时的样品中保证SDS-loading buffer浓度是1x的即可
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JacquelineLiu 先用BCA法测定蛋白浓度,根据浓度算出上样量,根据上样量的四分之一,加入5*的loading buffer谢谢
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【求助】western blot 蛋白可以在加loading buffer之前煮吗?
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这个帖子发布于7年零91天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
western blot 蛋白可以在加裂解液后,未加loading buffer之前煮吗?这样的样品还能用吗?
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碧峤 edited on
碧峤 western blot 蛋白可以在加裂解液后,未加loading buffer之前煮吗?这样的样品还能用吗?我不知道你是想研究变性蛋白还是非变性的,如果研究变性的,加完裂解液后是可以煮的,是为了使蛋白充分变性,而不破坏蛋白的结构;若是研究非变性的蛋白,就不能煮了!
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未加loading buffer之前煮,多数蛋白都会沉淀变性。再加loading buffer可能存在溶解不完全的情况,理论上对电泳结果还是有影响的。
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