我的车子低速行驶一冲一冲昨天在高速上正常行驶着突然间故障灯亮了,接着顿了几下就直接不会走了

第一份人类基因组_第一推动丛书苼

一般来说一想到被抢先报道的前景,第一反应就是既绝望又希望希望你的对手“某人”死去。你可能会考虑要放弃但是这可能会讓你没有任何明确的东西显示这几年的辛劳结果……所以很难不考虑重新尝试用你的对手相同的方法去和他竞争。虽然你现在落后但是呮要稍微比他聪明点你就可能赶上他。然后你的对手可能会彻底气疯了

——詹姆斯·沃森,《倾情DNA:基因、基因组和社会》

在我们开始測序首例人类基因组很久以前,甚至在确信我们将能够做这件事很久之前我们就开玩笑地猜测谁的DNA将特别荣幸能从头到尾被第一个阅读。谁将拥有科学好奇心、自信心和安全平静的头脑愿意测序他或她的基因组尤其当大多数人被遗传决定论者们吓唬得认为这将揭露他们所有的生物秘密时,谁将有足够的理解力理解遗传和环境之间深奥的相互作用从而愿意看到自己个人的遗传程序发表在网上

技术问题同樣也包括在内,很多问题归纳一下就是比起微生物使用的初级的无性生殖,性是怎样引入人类更多的遗传多样性的当谈到测序细菌基洇组,我们选择了参照复制品——所有这些都是相同的正如称呼所表明的——将提供一套同种DNA样本。因为我们使用高度纯系株的果蝇基洇组确保我们拥有的DNA尽可能排除变异但是当谈到人类基因组时,就有许多遗传变异像地球上的人们一样多。

因为人类DNA的结构是双螺旋狀有两条互补链,我们测序哪条DNA链无关紧要但是这里存在一个人类复杂化的问题。人类23条染色体中的每一条都是成对存在的:23条来自峩们的母亲包括X染色体,23条来自父亲或者包括一条X染色体代表女儿,或者包括一条Y染色体代表儿子(因此女性有两条X染色体而男性囿一条X,一条Y)

首先一个问题是,测序对象该选择男性还是女性男性有个优点,他既有X染色体也有Y染色体但是缺点是X和Y染色体只有┅半的DNA,而其他22对染色体却拥有所有的DNA;如果我们选择一位女性那么将有两个X染色体而没有Y染色体。如果我们只研究一个人我们应该選择一个普通人作为实验对象还是总统克林顿呢?那个人的责任和风险是什么这个人会同意吗?

早些时候清楚的是,当技术准备甫定要测定人类基因组变异的程度,将毫不怀疑地要付出巨大的努力选择谁做样本真的不是那么重要。无论如何如果可以在遗传测试中找到与疾病有关的序列差异的科学利益和商业利益,那么对我们来说获得尽可能多的遗传多样性是有意义的这就意味着我们应尽可能从幾个人那里测序公共DNA,并且创建一套一致的基因组序列这个序列不代表任何个体,而是人类总体的融合一份参照基因组。

吉恩·梅尔斯和他的小组做了几个计算,看在这个公共DNA序列中我们可以使用多少实验对象而不致引进太多的变异,以至于它将危及我们使用现有的算法和计算机拼接参照基因组的能力如果我们允许实际覆盖一个人的基因组来帮助组装的话,那么5个或者6个人就是极限了我们决定我們将尽力从男女双方得到一份混合的DNA,并且包括一些种族多样性

在TIGR,塞雷拉成立之前海姆·史密斯就发愁怎样创立最好的人类基因序列攵库,这并不只是因为他没有足够研究人类DNA的经验海姆和我有过几次讨论,讨论怎样取得人类DNA包括获得商业来源。但是为了生成文库而且为了完全确定我们知道它们里面包含什么,海姆必须从头开始

人类取样也意味着漫长的事先知情同意程序,这甚至将阻止我们在6個月建造塞雷拉的期间开始进程由于海姆和我渴望前进,下一步很明显:当开始寻找人类DNA捐献者时我们感到地球上再也没有比我们更知情的人了——我们对于测试他们的基因组并公布出来的可能的风险有深刻的理解。海姆和我都不认同过分简单的基因决定论概念——认為我们仅是我们的基因所创造的“我们”而且我们生活的轨道能从我们的遗传密码精确地预测到。同时我们都拥有一个对我们自己的基洇组本能的好奇心在我们心中,从来都不认为我们会承担任何医学风险除了可能对我们的心理的影响:我们可以预料来自我们的诽谤鍺们的政治攻击,如果他们知道了我们采用了我们自己的DNA

一旦我们同意使用这个方案,我们每个人都决定我们要为文库提供一个丰富而嫆易产生的DNA来源:以精液的形式(我们不久就开玩笑说谁将需要较大的试管)最后我们确定使用标准50毫升的无菌试管并且冷冻其中的精液。虽然海姆能轻易地把他的样本直接带入实验室而不让他的技术员知道试管的来龙去脉但是我们仍然认为如果我带着冷冻的试管溜进實验室并移交给他们,还是有些不宜借助联邦快递装有冷冻试剂的盒子几乎每天从应用生物系统公司送到TIGR,于是我拿一个装有干冰的已咑开的联邦快递盒子装入我的样本,然后把它交给实验室这样实验室大多数人以为样本来自于迈克·亨克皮勒或者托尼·怀特。这种诡計必须重复好几次因为最初的实验要消耗大量DNA

一旦塞雷拉崛起并开始运转,额外DNA测序的问题就变得和我们当初害怕的一样复杂了律师們介入其中,什么应该做什么可以做,他们提供互相矛盾的意见为了监视样本的整个测试过程,我拜访了国家癌症研究所前任主任萨姆·博德,他现在是塞雷拉的首席医学官员,他建立了一个由外来专家组成的一流委员会。开始时我通知萨姆我们已经有了两个DNA样本,这些样本已经被海姆转变成了TIGR的文库并且它们被用来做所有最初的测序以此启动塞雷拉程序。我向萨姆透露海姆和我都是捐献者并解释說其他人应该包括女性和保持尽可能多的人种和地域多样性。我让萨姆决定他是否应该通知委员会我们已经进入对两个人类捐献者的序列的解读工程;他认为最好不要通知,不过还是制定了一个与海姆和我曾做的不冲突的一个程序

阅读任何大众化的遗传学叙述,你会经瑺看见这些文字说DNA决定一切,从感情到疾病到智商(不论那是什么)到眼睛颜色在教室里,全世界的孩子们都被告知褐色眼睛是显性的——也就是说,父母之一方如果遗传给你一个对应具有显性特征的基因,你将也会拥有这个特征由此,如果一个父亲有褐色的眼聙那么他的孩子可能也有,而双亲都是蓝色眼睛的话几乎总是会有蓝色眼睛的孩子。

让我们假设你还没有遇见我或是没研究过这本书嘚外封套你已经决定通过研究我的遗传密码来找到我的眼睛颜色——就像租用玛丽二世女王豪华游轮穿过哈德逊河一样28。我的密码的其Φ一卷15号染色体,是一个好的开始之处在那里你会发现一个叫做OAC2的基因,它是褐色眼睛和蓝色眼睛主要的决定因素基因在专门的黑銫素细胞中活动,后者产生黑色的色素负责眼睛的颜色。我眼睛颜色的生理基础像任何其他人一样被黑色素细胞的分布和内容所支配,尽管过程比通常认为的要复杂得多1

根据一项600多人的正常有色人种的研究表明,眼睛的颜色不太可能是基于蓝色或灰色这种特殊基因的精确遗传拼写(在一个变体中,非蓝/灰色为字母A/T或T/T在另一个变体中,为字母A/G或G/G或者是两个变体的结合)。根据这些数据我的基因組显示,我更有可能有蓝色或灰色眼睛而不是拥有科学家们所称的“非蓝/灰色”变体,我有两个变体——一个是C/C和A/A第二个是G/G和A/A,而且峩确实是蓝眼睛然而我的基因组告诉我一个直截了当的结论,眼睛颜色实际上是依赖于几个基因的尽管不是很常见,但是两个蓝眼睛嘚父母是可以生出褐色眼睛的孩子的并且,尽管蓝色和褐色眼睛在高加索人中是显性的我们也有灰色/绿色/淡褐色和间于它们之间的色喥。简单和过分简单化的教科书对于眼睛颜色的遗传学描述没有做出符合自然的公正评判

委员会表达了两点主要顾虑。第一如果那个捐献了他们的DNA的人被识别出来的话,而且如果他们基因组中的任何疾病基因被识别出来他们就要冒可能失去他们的死亡保险和/或者人寿保险的风险。类似的如果他们有与各种不良社会特性或病态人格有关的突变,那么一旦他们的身份随着他们的遗传密码显示出来它就能引发这些对应的问题。我们最终确立的政策是由于责任和保护我们的捐献者的需要,塞雷拉将不再公开他们的身份然而,如果捐献鍺们希望的话委员会承认他们自己有权决定是否公开他们是捐献者。

第二点顾虑是关于测序不同种族背景的基因组我就“种族问题”呮与委员会会面了一次,因为真正的担心是数据可能被一些人用来替种族主义辩护对我而言,测序5个白人男性的基因组来代表人类根本僦是错误的尤其是在遗传层面上,我们看起来都是相同的当委员会听说这些争论时,很快就差异性达成一致我们想征集大约20个可能嘚捐献者并就此在《华盛顿邮报》上、塞雷拉公司以及应用生物系统公司周围做了相应广告,那么至少有两个记者提供了他们的DNA就不足为渏了其中一个还写了一篇有关塞雷拉捐献DNA过程的文章2

包括海姆和我在内的每个捐献者都要求听一节关于承担风险和事先知情程序的课并且签订必须的协议。当博德提供给我们一份他与顾问委员会一同起草的同意文件时我开玩笑说我们不想从任何有能力把30页的复杂法律文件通读下来仍然有能力射精的人那里得到DNA,因为他必须是一个律师

每个捐献者会因为他或她的样本得到100美元的报酬,对于女性来说样本是血液,从胳膊上抽取男人既要提供精液还得提供血液(尽管有几个拒绝提供精液)。(当这个过程被描述给一位知名的公众人粅时她讥讽道,“这场景真是无懈可击:男人获得高潮可以得到报酬女人却要被一根针刺一下。”)我们对获得的每一份样本分配給它的捐献者一个代号,只有博德有密码

我们试图为每一个捐献者培养细胞株并产生序列文库,接着进行测试序列那5个最后名单由我嘚高级职员来选择,其中包括博德以匿名的信息为基础,其中包括代码、性别和自认的种族以及既能提供永久细胞株又能提供好的序列數据的高质量的文库:这些人是海姆、我以及三名自称的非洲裔美国人、中国人和女性西班牙人。我仍然不知道任何女性的身份尽管幾名捐献者,包括记者在内后来公开了他们的身份,但是不重新测序他们的另一份样本就没办法在他们和测序的DNA之间建立连接。我们朂终发表的序列是五个捐献者的合成物我们的基因组序列甚至可以组装成一个合成物的事实证明了地球上的人类在DNA层面上的相似性。

在使用谁的基因组做测序这一点上政府计划甚至面临着更大的麻烦。科林斯和他的同事们吹嘘他们已经混合了15~20个个体的DNA这样最终的基洇组序列将来自数个匿名者。数年后众多的DNA BAC文库已经从博士后、实验室捐献者等人捐献的样本中产生了,但是这些捐赠者当时都没有考慮过一些棘手的问题比如伦理问题和知情同意问题。如果一个或更多的捐献者自我识别并拒绝自己的基因密码被公众使用的话所有的攵库就都要被摈弃,这使得公共计划随时面临挫折和风险然后几乎所有的公共基因组最终都仅来自一个或两个捐献者(这样有利于长时間地保守秘密)。

果蝇基因组最后的片段被测序后我就把塞雷拉的设备转移到对人类基因组发动全面攻击的战役上了。当时——1999年9月8日嘚早上——我们的技术小组和ABI员工的所有的努力已将测序机的故障率从曾经高达的90%降至10%。这就意味着我们仍然有至少30台价值30万美元的测序机每天都需要修理但是即使是故障率如此之高,我们还有足够的能力在300台能运转的机器上用不到一年的时间测序人类基因组

但是那時,我们还有压力:公共计划宣布它已经测序了大约1/4的基因组在另一次重大修订策略后,我的对手们宣布他们将只制作基因组的一个粗畧版本并且到第二年春天完成这个“第一草图”毫无疑问会伴随有一个媒体狂欢活动了。我们在塞雷拉所做的和已改变的公共计划所作嘚重要差异可归结为标准和策略:全基因组霰弹式技术对比于传统的分级测序法我知道我们已经有了获胜的策略,政府投资的实验室即使用相同的或甚至更大的测序能力也不能和我们竞争,除非他们放弃他们的标准改变他们的计划而采用我们的。

在开始我们的工作的湔一年1998年9月,公共计划的线路图已经改变:他们要在2003年前即在塞雷拉能够完成工作前做一个基因组草图2003年是沃森联合发现双螺旋第50周姩纪念。取代在10年间发表高质量数据的原始计划他们现在正努力尽可能快地把未分析的序列倾倒进公共数据库中。我的自称的竞争对手——幸存下来的5个基因组中心他们给自己起了一个绰号G5(这个团队是以G18开始的)——相信自己通过这样做,他们会阻挡我对基因组申请專利而且他们也会为首批完成人类基因组而获得荣誉。我为他们思想的愚蠢和不成熟感到困惑当我的许多批评者们正着迷于塞雷拉数據的发表时,公共投资的实验室正不在意地把序列倾注到公共数据库中制药公司正快乐地每夜下载这些序列,所以他们能在它们上面申請专利因此,反对人类基因组申请专利的人们制定的这个天真的政策肯定起了相反作用:基因专利申请得又早又快几乎所有的专利都昰基于政府数据,而不是塞雷拉的

多亏了在公共关系方面的文过饰非的精彩工作,降低公共计划的标准并没有遭遇过许多批评和分析姒乎没有人充分意识到公共计划通过改变它的目标,也有效地将高精确地完成一个染色体一个染色体的努力的目标改变为测序人类基因組的一幅又快又脏的“粗略草图”,有关“质量第一”的最初真言就到此为止了;认为基因组草图将削弱正确地完成工作的动机的担忧也箌此为止了这使得我们在塞雷拉所承担的工作呈现出彻底性和综合性。

关于塞雷拉的核心仪器3700型的测序仪的负面报道很多斯图尔特的尛组曾在《科学》杂志上发表了一篇对该仪器的评论3,声称它作为较短的序列片段的专用仪器——“阅读”——它没有提供什么优势(“茬资金投资方面没有马上增加生产力”)。这篇评论引发了ABI和塞雷拉公司股票价格的下跌具有讽刺意味的是,我决定使用3700型测序仪后对仪器的评价判断基本上被政府资助的小组忽视了,他们在购买这些昂贵的设备之前没有做通常要求他们做的令人讨厌的评估和分析,并且我们的那些保守派竞争对手也在争相尽快购买相对而言未经测试的3700型测序仪塞雷拉创办后的那年,ABI报道了10亿的销售额威尔康信託基金在3700型测序仪上花了比塞雷拉更多的钱,以便它的桑格研究所可以测序25%~30%的人类基因组同时,麻省理工学院借钱给埃里克·兰德购买比政府准备资助的更多的仪器,借钱的前提是他从弗朗西斯·科林斯那里得到了资助(资助一年的金额为4000多万)的基金管理费这使他有叻公共计划里最大的经营运作。

多亏了G5的策略的改变我的老板们站着就挣到更多的钱。亨克皮勒和怀特高兴地给公共计划提供产品现茬公共计划打算买价值数百万美元的3700型测序仪和试剂,怀特们就像军火商发动一场战争以便他们可以把武器卖给交战双方当我的小组注意到我们的企业“伙伴”以较快的速度装备我们的对手们时,不免士气低落我不得不努力使他们精神振奋起来,这真令人丧气

用相同嘚仪器来阅读遗传密码意味着——除了政府资助计划的非同小可的10倍多的金钱和人力资源——塞雷拉和公共计划之间胜负取决于我们各自嘚科学策略。用得最多的词测序意味着遗传密码的字母真正地以适当的顺序组装;没有人会认为只是通过往桌子上扔几张碎片就能组装了┅个拼图玩具然而,因为政府资助的实验室正在做数千个微型基因组计划通过一次一个地测序BAC复制体,他们不得不处理数千个小型的拼图但是我们只要做一个大的就可以了。我从来不曾想象他们会想要拼接他们所有的拼图碎片——BAC复制体或者染色体。我正在为我的科学的完整性下赌注希望它能占据上风;也为我的程序员们、我的方法和我的高功能的计算机下赌注,希望它们把如此庞大的公共计划淘汰出局

用霰弹枪序列拼接一个DNA序列,只要求很少的序列覆盖范围比如,1倍或单一的含有10万碱基对的BAC复制品这意味着你已经生成了10萬碱基对的DNA序列。但是这并不意味着你已经一次性测序了复制品的每一个字母潜在的困难是这些被随意生成的DNA片段(比如,如果你把一張报纸撕成50块碎纸把50张这样撕成的碎纸混合放在一个盒子里,然后随意抽出50张碎片那么你肯定不可能最终拼成一份完整的报纸)。把這些任意片段再放回到一起就像统计方法所预料的,你会发现1倍的覆盖范围实际上仅代表了66%的复制品的DNA序列(一些部分将被复制;其怹的将会丢失)。3倍的覆盖范围被要求覆盖96%的序列用政府计划的序列聚合法,它将用8倍到9倍的覆盖范围安排和确定片段重构一个BAC复制品我们曾认为我们也会需要那么多。但是我们的果蝇试验成功后我知道我们能够只利用很少片段就可以获得比)

1999年11月12日,埃里克决定告诉弗朗西斯·科林斯关于合作提议的事。埃里克说他得将已经达成的协议作一个概述并且还说“关于可接受的协议精神,有足够的共同点认為我们能够做而且有合适的时间让他们(克雷格、阿诺德[列文],可能是迈克和托尼·怀特)和我们(你、哈罗德我和任何另一个重要的囚)讨论”。然而直到后来他才感到了麻烦。当进行到参加双方的核心讨论的关键问题时埃里克被科林斯挤出了会议,并且被强势的誹谤塞雷拉者所替代——萨尔斯顿、沃特斯顿和来自威尔康信托基金会董事会的马丁·鲍布洛(Martin Bobrow)科林斯一定会和瓦尔姆斯一起出席的。我已经和联邦政府中的几个人物之一能源部的阿里·帕特诺斯,建立了良好关系,但是他没有被邀请。托尼·怀特坚持要去,亨克皮勒吔是因为科林斯等人现在是他们的主要客户,并且在过去的几周内他曾经把他们十亿分之一的编码字母和完整的22号染色体储存进基因銀行,相当于2%的基因组我感觉我们正接近一场第一顺序的灾难;这对阿里来说也是显而易见的。

在准备会谈的过程中科林斯准备了一份文件,在里面他替换了一些曾经在与兰德的讨论中协商过的条款文件被贴上了“共享原则”的标签,尽管它们只是被小组成员分享峩们同意在杜勒斯机场附近的一家旅馆会面,那儿曾见证过我早先的和弗朗西斯和谐相处的期望的落空,我知道我现在的情况注定要比鉯前更糟糕但是12月29日,我还是勉强去了杜勒斯

科林斯和鲍布洛以通常的政治辞令开始,毛遂自荐说自己是圣人每晚把未加工的数据存入基因银行,而我们是罪人因为我们最终正帮助一些药物公司,这些药物公司想保护他们投资的上亿美元想把这些数据转化成药物專利。当讨论最后转到联合型数据库和一个可能的合著文献时那些“分享原则”很快被证明什么也不是了。问题是我们的批评家们既不奣白商业现实也没有开放心理去探究原因、进行讨论或准备妥协。他们要我们在数据、方法和我们工作的荣誉方面做出让步;但他们却沒有回报地做出任何让步沃特斯顿宣称塞雷拉数据应该马上被利用,他不关心因塞特或任何其他公司是否会用这些数据来与塞雷拉竞争在托尼·怀特的对于最后一项建议爆发性的回应渐渐平息后,很明显会议结束了但是对它的反响几年之内都能感受到。

尽管科林斯的团隊不愿意协商或妥协但是他们现在能有本钱说他们与我们有着共同的兄弟情宜和真正的合作精神了,因为托尼·怀特以极其无礼又不切实際的要求作出了回应(怀特的确坚持说合并的数据库3~5年间不能被其他人使用,但是这项要求的提出是由于对公共计划方面不妥协的失朢它是给任何想责备塞雷拉并想迫使协商崩溃的人的一份礼物)。

当科林斯团队坚持说数据必须公开、免费和无限制地为商业利用时怹们也因为想到我们将利用他们的数据与他们竞争而深深地感到失望和苦恼。詹姆斯·史瑞夫把我们比作20世纪50年代的科幻B级电影里的怪物“可以吸收发射到它们两翼的火箭炮和导弹的能量,借助试图摧毁它们的人的力量变得更强大”22甚至就在杜勒斯会议破裂时,科林斯還偷偷走到我这里再一次要求关于塞雷拉文献的合著者地位

政府或威尔康信托基金会成员随后总结了他们关于塞雷拉地位的观点,将4页紙的陈述交给我日期是2000年2月28日,其中包括一个最后通牒(在第3页底部)说除非他们到3月6日收到一次回应,否则对于一起工作的讨论怹们将认为是在我这方面没有更进一步的兴趣。备忘录送到我办公室的时候我正在国外,我的助手林恩·郝兰德(Lynn Holland)通知科林斯我有两個星期的行程等我回来时我会回复的。威尔康信托基金现在依赖于一个未成熟的策略把更多的压力加到我的身上3月5日,星期天信托基金会发表了2月28日那封信的复印件,上面标着“机密”送给了《洛杉矶时报》科林斯否认与消息泄漏有任何联系。那时他正受到自己嘚管理部门的批评,因为这次事件给国家卫生研究院资助的增加投下了阴影正如公共计划的一位成员承认的,“对于国家卫生研究院来說卷入这次泄漏事件就是场政治灾难。”23

威尔康信托基金会桑格中心的蒂姆·哈伯德(Tim Hubbard)把一份备忘录传给萨尔斯顿、摩根和其他人ㄖ期是3月5日,上面解释了为什么泄漏了文件:

塞雷拉官员们作了多次声明关于他们可敬的意图,已经被广泛报道了从这和其他发表的攵件(《财富》杂志)看,他们的态度实际上是愤世嫉俗的焦点在获得最大限度的货币利益,不考虑对于世界范围医学研究的影响鉴於人类基因组的唯一性,显而易见的是他们希望尽可能地锁定,而不考虑对于学术和商业研究和发展的抑制效应

塞雷拉做果蝇试验成功后,这是不是一种酸葡萄现象呢备忘录敏锐地问,当然不是:“塞雷拉团队做了未经证实而且过分夸大了的声称。”

科林斯和他的團队经常提供给《洛杉矶时报》的两名记者保罗·雅各布(Paul Jacobs)和彼德·高斯林(Peter G.Gosselin)一些内部情报这次他们相当关注威尔康泄漏事件,把信转化成一篇头版故事一篇达1 348字的头版故事24。他们引用了托尼·怀特的话这是一次背信行为,它破坏了本来注定会有的更进一步的关于聯合计划的讨论:“把那封信送给新闻界是卑鄙的”当我第二天被要求对此进行评论时,我也持相同的观点证实了备忘录的发表充其量是片面的,而且同时最坏的问题是它的时间是不恰当的,以至于我没有机会在最后期限之前作出回应

第二天,《华盛顿邮报》报道說:“如果信件的发表确实意味着给塞雷拉施压它不起作用……塞雷拉的计划非常好,通过把这些数据和那些被公共资助研究者们产生嘚数据合并公司今年有希望发表一份完整的人类基因序列,比人类基因组计划设置的最后期限早3年那意味着,是塞雷拉能获得现代科學最伟大成就的荣誉而不是耗费了这么多年生活在基因组计划上的学术研究者们获得。”25那天我反复重申我的立场塞雷拉仍然对合作感兴趣,并且研究院的信“明显说错了”我们在知识产权保护上的立场

在几天之内,格里·罗宾也表示了对我们的支持,他告诉《纽约时报》说,国家卫生研究院的官员们可能会把我们推到太为难的境地:“我认为一家上市公司的领导层无法负担放弃他们所拥有的一切”塞雷拉和我“完全遵守信件和他们协议的精神”。当提到果蝇基因组时格里说他对让塞雷拉发表数据的压力表示疑惑,因为它已经发表叻比任何其他的竞争者多得多的数据26一名记者评论说:“被认为是人类最高尚的之一的人类基因组计划,越来越像一场泥浆摔跤比赛”27随着争论的升级,约翰·萨尔斯顿最终也明白了事实:“许多人控告我揭发隐私、妒忌、保护我的地盘……我已经进入了政治世界。”28怹承认泄漏事件是一场灾难。

几天后科林斯和摩根透露,他们仍然另有一个锦囊妙计当然最后也是引火烧身。到此时多亏了牛市,或者说多亏了22号染色体的成功揭示塞雷拉股票正在飙升猛涨。通过克林顿总统和托尼·布莱尔首相各自的科学顾问尼尔·莱恩(Neal Lane)和鮑勃·梅爵士(Bob May)(现在是牛津的梅勋爵)摩根努力游说让两位国家首脑做一项有关人类基因知识产权的联合声明。经过全面编辑和多佽延期后在沉闷的新闻时间段,白宫决定先召开记者招待会科林斯和莱恩也参加了。由于担心塞雷拉可能会宣布它的首次草图这次聲明也被用来平息英国的恐惧,白宫给他们的笑容比给公共计划的都多在国家科技奖颁奖晚会上,克林顿总统说:

这次协议郑重宣布這本写有所有人类生命的生命之书是属于全人类的每一位成员所共有的。人类基因组计划得到了美国和英国的资助要求它的拨款受益人測出他们发现的序列,并在24小时内可以被公共使用我强烈要求其他国家、科学家和股份公司接受这项政策,尊敬它的精神我们必须确保人类基因组研究的利益不是用美元而是用人类生活的改善来衡量。

鲍勃爵士认为它是“一项原则的温和陈述”它“可能倾斜了道德景觀”,并且通过阐明专利和所有权问题它将“应该是加强而不是削弱市场”。莱恩同意它只是重申了现存的政策:“没有人挥舞旗号沒有人说这可能是一个你需要改变政策的信号,没有人说你处在错误的方向或者向你施加压力。”

但是白宫发言人约瑟夫(乔)·洛克哈特(Joseph[Joe]Lockhart)给新闻界留下的印象却不是这样当他那天早上向记者做简报时,他建议总统应该计划限制基因专利;这些建议是在CBS广播新闻采訪中和一群挤进洛克哈特办公室的不带相机的记者面前提出的这被看做是对生物技术界尤其是塞雷拉的一次沉重打击。

那时当股市正處于“非理性繁荣”高峰期时,突然出现了暴跌白宫很快采取行动试图把这个毁灭性的妖怪再放回到瓶子里。不同寻常地莱恩发现自巳被要求在午饭时间做一个介绍。他仍然忽略了市场里的大屠杀在詹姆斯·布莱迪简明新闻发布办公室,他说;“我想完全清楚地说,这个声明与任何正在进行的公共与私人部分之间的讨论没有任何关系。”29和他一起的是弗朗西斯·科林斯,他抓住机会告诉新闻界公共计划是怎样提前并且按预算进行的。对于现在事态的发展,他似乎有些幸灾乐祸,并透露了不同的信息:“我认为这是一个相当有意义的一天,我很高兴在这一天来到这里在这里,关于有权进入人类基因组序列的重要原则——作为人类我们共同分享的遗产——得到了自由世堺的领导层的支持。”30

在记者招待会上“与塞雷拉的人发生争吵”的话题被提出,而且一个记者问声明的目的是否是“鼓励文特尔和塞雷拉回到谈判中并且让他们简洁陈述一个关于他们将分享他们的信息的正式协议”,莱恩回答说联合声明“适用于每个人”科林斯重複了类似的真言:“不仅仅是被提到的专利问题;也是马上发表数据的问题。”

当另一个记者指出“股票今天正在迅速下跌”莱恩回答,他“没有看见任何理由”可以把股票暴跌和已做的声明联系起来“我们的理解是塞雷拉赞成这个声明,”他补充说但是几分钟后,怹又承认:“我不清楚他们是否被提前被告知声明要说什么”那天他最后说了一些稍稍安慰股东的话:“我们想使人们的生活更好,这個声明给出的原则我们认为也是为了这个目的”

莱恩和克林斯的安抚没起多大作用,股市第二天继续下跌在两天时间里,据估计生物技术的股票总资缩水近5000亿美元塞雷拉缩水了近60亿美元,时至今日鲍勃爵士先生仍坚持称声明“说了些明智的话”,而股市反应的方式昰“反常的……它正在寻找调整借口”尼尔·莱恩引用了市场反应作为一个例子说明:“一个相对小的事情,当它出现在白宫时也能有巨大的反响。”

《华尔街日报》的一位编辑打电话问我成为美国经济最强大的人物之一有什么感受“更穷了”就是我的答案。我正要成為第一名生物技术亿万富翁时我的股票暴跌了,开始几个小时就直线下跌3亿美元由于忙于基因组而没有充分使用魔法师号帆船,一年湔我卖掉了它但是现在我正在法国南部协商买一艘漂亮的47米长的纵帆船,盼望着我不久将能再次航海我甚至把桅杆重新刷了漆。这条船要求有12名船员它要花我大约1500万美元,加上每年维护费200万或300万美元这条纵帆船的德国主人了解股票市场,当我告诉他我认为我可能再吔购买不起它的时候他表现得很通情达理。取消了合同我失去了3万美元预付款。

虽然我失去了我从来不曾拥有或指望的钞票将用来發展新疗法研究的数千亿美元一夜之间化为乌有。信任我和我的眼力的投资者们同样遭遇了这个结局这也附带有法律结果:一位股东通過一家律师事务所提出了诉讼请求,这家事务所专门从事某家公司的股票价格暴跌时进行的集体诉讼它的论据大致是,政府因为我们与科林斯等人失败的谈判而惩罚塞雷拉塞雷拉没有发布这些决定性的讨论正与政府协商中的信息。这正是律师们所拥有的奇怪的类似思想:我们正因为没有提到从来都没有发生过的合作而被指控

数百亿美元从股市流失,白宫的压力很大克林顿总统在发表声明之后的一天,他给予了纠正解释说,这个声明的目的不是要对基因的专利性或是生物技术工业造成影响由于出现了纰漏;克林顿和摩根成功地给皛宫带来了尴尬。在股市崩溃、信件泄露给《洛杉矶时报》后总统命令尼尔·莱恩结束基因组战争。“搞定它……使这些家伙们在一起工莋。”31

莱恩曾经对基因组冲突大为震惊他高兴地答应把信息传递给科林斯。第一个明显的影响是对塞雷拉的攻击降低约翰·萨尔斯顿称它为一个“笼头”:“塞雷拉成功地使弗朗西斯保持沉默,这对公司来说是很有价值的。”32对我而言,它是特别的一天对科学界来说,它是悲伤的一天在这一天,要求美国总统介入来停止无休止的污蔑中伤然而,我从与政府的接触中学到了一个教训那就是只有傻瓜才会疏远和离开政治。我很担心科林斯会耍花招利用白宫留下一个印象那就是,政府和威尔康信托基金会是唯一卷入测序人类基因组嘚两个当事人不管他们是不是第一个完成的。科林斯在玫瑰园到处散布得到了总统和英国首相的支持这次宣传将比我只有一个女性的公关队伍所做的一切事情的总和还要多。

当时似乎是我得到了总统的关注。1998年3月千年祈福第二夜我不仅与克林顿一家共进晚餐,而且克莱尔和我还拜访了他们在白宫的私人住处当时我们喝健怡可乐、葡萄酒和啤酒一直到凌晨,我们讨论每件事从斯蒂芬·霍金的演说到总统怎样整理床铺过快(希拉里相信被子应该透透气),甚至有一个提问时间,在此期间希拉里解释说,考虑到科林斯的职位是一个联邦官员她感到他已经错误地混淆了科学和宗教。

但是基因组竞赛进入最后一轮时发表国情咨文演说集会上,是科林斯与第一夫人同座而我似乎已经失宠了。当千年祈福第八夜降临时他们建议我谈谈基因组,但是兰德参加了我们的威河会议两天后,是他而不是我走仩台去讲演

1999年10月在白宫,兰德作了《信息学遇到基因组学》的讲演33按照惯例讲述了数据怎样不得不被公开的情况。(“很明显有关囚类基因组的信息必须免费为全世界的每个人所利用。”)克林顿尤其被兰德的陈述所打动兰德称,从遗传学角度讲所有人类99.9%以上都昰相似的,克林顿就想到“所有的种族流血冲突……就是为了这千分之一的区别”34

“克雷格现在是不受欢迎的人,”我的助手的熟人如此告诉她传话人曾经在白宫工作过。我们花了一些时间寻找出现这些流言的原因事情追溯到一个月前,在迈阿密海滩召开的第11次基因組测序和分析会议中我们举行了一个特殊的全体会议,讨论有关DNA技术的应用来自应用生物系统的一些人推荐要请来自联邦调查局的一位女性讨论法医DNA测序,这是一个销路好的市场全体会议之前,我与她见了面并且吃惊地听她描述了一年前,为了进一步调查当时所谓總统与莫尼卡·莱温斯基的桃色事件,她是怎样在白宫从总统那里获得了一个DNA样本的

当我在会议上介绍她时,我笨拙地参考了莱温斯基事件那时,这件事已经公开化一年了35——我提醒与会者,大多数人曾经参加过的前一次会议上我们遇到的蹊跷:总统要做一个基调讲演但是就在要开讲最后一分钟前,他取消了他还曾经为此而道歉。现在我知道原因了我解释说,他当时与我们下面的演说者有一个约會如果事情当时就这么结束了,那么我怀疑白宫也就不会关心这件事了但是联邦调查局的特工不仅以评论莫尼卡门丑闻开始她的演示,而且继续用幻灯片显示了那条臭名昭著的蓝色裙子这是一条圈住了世界上三个最著名的DNA样本的裙子。她讨论了她能从每个斑点获得多尐DNA以及每个斑点包含大量的精子。她继续描述1998年8月3日从总统那里获得血样然后用他的血液和她从蓝裙子上分离出来的样本上做了DNA分析。她演示一张张幻灯片证明血液样本和样本K39中的DNA相匹配,解释说在白种人中,这种随机匹配的几率是7.87万亿分之一她最后一张幻灯片昰显微镜视野下的总统的精子。

一个现任联邦调查局的特工对这件有激烈争议的案件了解得这么详细说我很震惊那是保守说法。当有人紦这一切报告给白宫时我扮演的角色是怎样被定位的还不清楚。但是我最终发现过分保守的员工们已经决定抵制我,并且因为联邦调查局的特工的应用演示而责备我我不想成为蝴蝶效应的受害者,一只昆虫扇动翅膀——联邦调查局的特工——引起一场巨大的风暴这個风暴以代表科林斯和政府计划的单方总统公告的形式出现。但是我能看见乌云正在聚集

5月4号,我在家接到来自能源部的一个朋友阿里·帕特诺斯的电话,这电话本身并没有什么异常,因为我们经常通话,通常都是在每个周日。但是那晚他随意提到的事确实让我思考了一下他邀请我去他的市区住宅喝一杯,还说弗朗西斯·科林斯可能会进去坐一坐。弗朗西斯住在相同复杂的市区住宅里,几乎从阿里家穿越了整条街。考虑到我已经完成的工作,我勉强可以理解了。塞雷拉测序计划做得不能再好了,终点在望了。塞雷拉将首先测序出基因组,它比政府计划的工作质量更高。除此之外,我上次虽然与弗朗西斯有过温馨的交谈,但最终却以集体诉讼和损失数亿美元而告终。

后来弗朗西斯在对我们的见面的描述中说道假如和事老的角色就是决定结束敌意,掩埋战斧并且提供给我橄榄枝的话,那么是他先摆出了这個重要而高尚的姿态(“我找了一个文特尔和我共同的朋友[阿里·帕特诺斯],要求他安排一个秘密会面”36)但是这个主意事实上是阿裏出的,正如他回忆的“说服文特尔参加秘密会面比说服弗朗西斯给我带来的麻烦少得多。弗朗西斯推诿了几个月宣称他需要从国家衛生研究所老板那里得到安全许可。”

我由此明白阿里不是因总统所下的“让这些家伙在一起工作”的命令所驱使而是他意识到我们都被我们各自的环境、同事和顾问们从现实绝缘了,因此想要让和解从注定失败的阴影中走出来,就必须从一个正式会议的紧张的氛围中跳出来(正如阿里自己所说的,“他们需要从这些茧壳中抽身出来并且被带到他们能做回自己的环境中。”)那时我推测阿里已经咑过电话,因为科林斯和政府资助的实验室人员都关心塞雷拉将做一个先发制人的声明声明我们已经在他们修补与白宫的关系之前完成叻基因组测序。

当然他们有权不满能源和环境众议院小组委员会呼吁举行人类基因组测序计划听证会,并且邀请我在4月6日听证会发言囿我的小组的鼓励,我采取了一个坦白、率直的方法我仔细解释了一个被测序的基因组和从BAC复制品中得到的序列之间的差异。在前者中遗传密码的碱基对顺序在整个基因组是已知的(塞雷拉工作状态),而后者当中大多数序列都没有组装或排序(公共基因组工作状态)。希瑟和我认为听证会提供了最好的机会宣布我们的进程我们发表了一篇新闻稿——《塞雷拉基因组学完成一份人类的基因组测序阶段》——为了将关键信息传递给政府基因组人员,所以他们知道我们离大型发布非常的近了它将在拼接过程结束后的任何时间举行。科林斯抱怨说新闻界误解了我们的意思但是我们不是虚张声势吓唬人,我知道他也知道这个同样,我知道拥有总统对我们所做的事的支歭将会抬高我们的成就而不会造成学术争论,并且确保它在历史课本中的位置

阿里让我放心,他会确保他、科林斯和我在他家里进行嘚讨论绝对是非正式的并且我可以否认任何一次曾经发生过的严肃谈话。由于来自阿里的强大压力以及我个人的感觉驱使我需要做一些白宫希望做的事,我同意一天晚上顺便去拜访一下阿里

阿里住在一栋典型的三层楼的市区住房里,地下室有一个娱乐室/家庭娱乐室茬那里弗朗西斯已经在等着了。阿里开始不停给我俩啤酒气氛很紧张。谈话慢慢地以当前的琐事开始好像真的只是一次偶遇。几杯下肚之后谈论转向了更严肃的问题,考虑一个由白宫或至少涉及总统的可能的联合声明关于在《科学》杂志上联合发表或同时发表文章嘚事也被提及。谁都没有对任何一方做出承诺不过我们都承诺对我们的交谈保密。又喝了几杯后弗朗西斯和我一起离开了,开玩笑说鈳能会有一个摄影师蹲在树丛中当他走向他的家时,我进了我的车然后开车回家了。

我告诉了克莱尔发生的事她的反应很坦率:你參加这样的谈话简直是神经错乱了。但是尽管如此会晤仍然继续,不止克莱尔一个人表示不赞成会晤希瑟已经成为我重要的顾问和朋伖,她也很生气以至于朝我大叫,或者干脆拒绝谈论此事但是我继续谈,就像在我们以前的谈论一样我也感到科林斯现在除了与我站到同一立场,别无选择

尽管科林斯还没有和威尔康信托基金会或华盛顿的兰德谈论这个计划,我们给自己订了一个简单的目标:当塞雷拉完成它首次人类基因组拼接时在白宫与克林顿总统做一项联合声明。那时政府将对它自己的计划做一次进度报告,我们将宣布我們会一起工作在《科学》杂志上联合发表文章。事情进程已经到了联系《科学》杂志的编辑唐纳德·肯尼迪的地步,看他怎样处理最终的攵章当然,塞雷拉要求设法限制它的商业竞争者下载和转售它的数据如果我们在欧洲,这原本不是个问题因为在那里,新法律已经淛定允许有独特数据库的版权。美国国会仍然在激烈争论这个问题丝毫看不见解决的希望。肯尼迪鼓励我们所有人与他合作他因为《科学》杂志将发表这个历史性的成就而感到兴奋。

保密不久变得甚至更重要了因为白宫不希望被抢风头。我需要我的高级小组成员进叺讨论当然,他们不高兴我正放弃我们的优势放弃使我们的攻击者难堪的机会,以及放弃单独拿奖的机会希瑟仍然很生气,认为我巳经失去了我的理智海姆和吉恩看起来极不自在,仍然对公共计划深表怀疑考虑到我们曾忍受的一切,他们的反应不足为奇他们和峩一样,十分关心与政府人类基因组计划的公共关系战争将掠走我们的时间我们想要并且需要时间来分类整理我们的数据以检查它们的質量,并且分析它们的意义而具有讽刺意味的是,我们现在需要更多的时间来处理公共数据的混合质量

我的同事们不是唯一对折中方案反应冷淡的人;我也被其他人指责,有时候甚至是严厉指责在拉荷亚与斯克里普斯研究所(Scripps Research Institute)的领导人理查德·勒纳(Richard Le rner)的一次晚宴Φ,基因组竞赛的最后阶段出现了当我告诉他,我至少打算与政府计划发表联合声明勒纳大发雷霆。他把它比作奥运会中的马拉松比賽只有在终点线才能停下等候下一个运动员出现,然后才可以手拉手一起穿越。他的观点是需要让国家卫生研究院和政府为他们的傲慢吃一次教训如果我仁慈一点,那么我将会使数千人失望他们是我反抗政府对科学社团所犯的所有错误的力量源泉。

白宫要求我提供┅个时间问我觉得什么时候我们能完成第一次拼接,我与吉恩·梅尔斯和生物信息学小组一起计算出计算机将花多长时间才能把序列拼装在一起。我给了他们一个估算还告诉他们,我所提出的时间有一个较大的缓冲他们反过来通知我定的特别的日子不能用,而指定了比峩早几个星期的一天这让小组甚至更惊慌。在阿里家的地下室进行的讨论继续着(每次弗朗西斯和我出现时他妻子和孩子很不乐意地被赶出去)。6月26日被确定下来有了最后期限,这激励我的小组更加辛苦地工作尽管他们一直在全力以赴。有一个真正的危险是在结束之前我们可能会失去动力。

在我与弗朗西斯和阿里的谈话中我们消耗了几盘比萨饼和啤酒就决定由克林顿总统主持这次事件,托尼·布莱尔将通过视频直播连接从伦敦参加。首先,总统先讲话,接着是布莱尔然后是科林斯,最后是我我们每个人都有大约10分钟的陈述时間,我们同意提前共同分享文本虽然我很高兴这个安排,但是对于要说什么以及怎样描述我的小组在塞雷拉的工作我们仍然小心翼翼。克林顿和布莱尔最后一次就此事公开发表言论时塞雷拉股票每股下跌了100多美元。如果那样的事再次发生那么同意这些讨论的代价将昰失去我的工作。

会议前一周“高级行政官员”通知新闻界说科林斯和我将就基因组测序工作的完成发表声明,总统克林顿可能参与37《华尔街日报》称,“白宫的一项联合声明发出了一个强有力的象征信号政府和私营部门可以在重要项目上合作,行政官员补充说达荿一条协议,即在仪式上共用一个讲台是数周协商的结果。”38文章继续指出“联合仪式将与其他谈话一致,目的在于协调各小组的发現的科学出版也许到了秋天,尽管不能确保会达成这样一个协议”

随着日子一天天临近,压力在增加但是到那时为止,整个进程是無法停止的一旦我同意平局,那么在敌意再次突然爆发之前我们想在白宫尽快宣布它。我每天都收到从阿里或尼尔·莱恩那里打来的电话,他们问我拼接是否已完成了。拼接还没完成,但是我向他们保证,它不久就会完成,并且几乎每小时都要核对计算的进程。我们正在用康柏的“血刃”29芯片它正与大量数据作斗争。由于电脑死机巨型计算机需要重新启动许多次。为了检查拼接过程每个阶段的进程吉恩和他的小组根本不能入睡。分段算法的一个优势在于继续进行下一步之前我们可以评估每一步的成功。这也极大地帮助我们缓解了惢理压力因为我们知道我们正在取得真正的进步。

最初的拼接在公告发布几周前完成了但是拼接是建立在所谓的划分方法论基础之上嘚,而不是整个基因组之上实质上,基因组通过把数据串拼接成数百个小一点的块状来完成这些小块被分配到基因组中合适的地方,鼡公共图谱数据而不是一次性决定整个序列。但是公共数据没有包含整个基因组我们仍希望完成整个基因组。在声明之前一两天时拼接程序“宏大”看起来似乎它要真正实现基因组了。

显而易见我们确实在第一次拼接人类基因组中获得了成功我把注意力转向了我在皛宫的发言。我知道总统、首相和科林斯正在使用职业的演讲撰稿人但是毕竟我投入了这项工程,我想写下我想要发表的每一个字我被告知将会有广泛的新闻报道(保守陈述),而且我们的评论将会在全世界几个频道上实况转播包括CNN和BBC。当我们被告知这将是历史上的苐一次一个重要的科学进步从白宫被宣布出来时,我感觉更有压力了我发现自己在作斗争,不知道该说什么以及该怎么说同时,我收到了总统克林顿的发言草稿既大方又激励人心,我开始感觉更加不适应这项任务了第二天,科林斯发言稿的复印本到了我必须承認,给我留下了深刻印象现在我正开始后悔没有用一个演讲撰稿人。每晚我都坚持熬到很晚,有时候只能写几个句子或者一段话为叻要我在白宫东厅的电视现场直播上要说的话的复印本,白宫正给我施压电话变得更疯狂迫切。这时我收到了托尼·布莱尔的演说词复印本,我的血液开始沸腾。这份讲稿由他的首席科学家鲍勃·梅爵士起草党派性很强,我怀疑威尔康信托基金会对他的讲稿有重要的影响

我很不安,以至于给阿里打了一个电话告诉他如果布莱尔发表这样的演说,我将抵制白宫的颁奖典礼举办我自己的记者招待会。阿裏试图使我平静并许诺马上给尼尔·莱恩打电话,他告诉我不要轻举妄动——事实上,不要做任何事或给任何人打电话直到我从他那里或尼尔那里得到回复。尼尔最后打来了电话,他想和我一起讨论布莱尔的演说一行一行,以澄清对我冒犯之处当我结束时,他清楚地明皛我的处境并且同情我,但是他说他能做的很少。“我能改变任何你想在科林斯的演说中想改的东西甚至总统的,但是你让我改变┅个外国元首的主要国际演说我不能那样做。”

我记起了科林斯和我在地下室讨论中的搪塞当时他告诉我,对兰德在他之前做的事怹不能为他的同事辩护。科林斯还说他与最后写给《洛杉矶时报》的信的发表没有关系,他已经批评了威尔康信托基金会如果曾经有囚欺骗我,那么就是对他的耻辱;如果欺骗第二次发生那么是对我的耻辱。我不想让它再一次发生在白宫的电视现场直播中我很坚定:如果布莱尔的演说还是那个样子,我就不会露面尼尔请求我等一等,至少给让他尝试改变它的时间

作为一个乐观主义者,我不停地繼续做我的文本并且坐在我家办公室的电脑前直到午夜后,电话铃响了这是尼尔·莱恩安慰的声音,他向我保证,每个人都收到了我的信息,托尼·布莱尔的演说词将会被重写。我能先看副本吗?他保证演说词会改变,并且我将会满意。现在我同意参与吗?我向来知道尼尔是可敬而率直的,所以我接受了他的话。谈话很快转到我的演说上我向他承诺副本早上6点前送到,电话里我详细告诉了他我想说什么尼尔似乎很满意。我们下一次见面将会在白宫那天早上我们要向世界揭示人类之书。

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