该作增加了尤里阵营（尤里阵营無剧情）游戏接续《红色警戒2》的盟军剧情，讲述了苏联与盟军再次开战的故事游戏接续《红色警戒2》的剧情，讲述了尤里在逃脱盟國抓捕后启动了大战期间悄悄搭建在全球各地的心灵控制器，企图控制全人类的心灵不论是盟军还是苏联，此时反抗已经为时已晚唯一的办法就是利用时间机器回到大战初期改写历史。 战役依然分为盟军篇和苏联篇如果玩家扮演盟军指挥官，最终能在南极活捉尤里并将他终身囚禁在心灵隔离室中；如果玩家扮演苏联指挥官，苏军将抢夺时间机器回到过去挫败尤里的阴谋，逆转了苏联战败的命运最终征服地球，开始向外太空发展

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