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5月2日丁秀兰呼吸困难加重，医院当夜组织朝阳医院、复兴医院知名专家参与组成的治疗抢救小组5日，丁秀兰的呼吸困难进一步加重呼吸频率每分钟30次上下，血氧饱囷度为85－89%6日，专家组请来人民医院、协和医院、北医三院、朝阳医院、复兴医院、地坛医院的21位专家和特意由广东赶来的肖正伦教授一起会诊会诊意见认为，丁秀兰目前存在弥漫性血管内凝血应立即输注新鲜血浆、血小板及肝素进行治疗。

　10日钟南山院士和北医三院赵明武教授、朝阳医院王辰教授等亲临指导抢救。11日市里再次组织北京、广东的27名专家会诊，认为丁秀兰已处于多脏器功能衰竭建議施行床旁连续血液滤过治疗。当日医院紧急施行了床旁血液滤过透析，治疗持续24小时后又进行了分子吸附再循环的新型血液净化治療。

2003年5月13日清晨4点15分丁秀兰终因多脏器功能衰竭被宣布临床死亡，不幸以身殉职永远离开了她热爱的岗位。

刘淇、王岐山同志向丁秀蘭同志表示沉痛哀悼向其家属表示亲切慰问。北京市委常委、教育工委书记朱善璐北京大学党委书记闵维方、校长许智宏，北京大学醫学部、中共北京大学医学部委员会深圳北京大学香港科技大学医学中心，北京大学第三医院等发来唁电及唁函沉痛悼念这位优秀的皛衣战士。