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原标题:北大贾桂芳课题组开发無需抗体的酶辅助化学标记N6-甲基腺嘌呤(m6A)测序技术

2020427北京大学化学与分子工程学院贾桂芳该课题组Nature子刊《Nature N6-methyladenosin研究论文,首次報道了利用FTO酶辅助实现了RNA修饰m6A化学标记并成功应用于转录组m6A高通量测序。

随着首个RNA修饰N6-甲基腺嘌呤(m6A)的去修饰酶FTO的发现RNA表观遺传学/表观转录组学开始兴起并成为表观遗传学新的研究热点。m6A作为首个被发现的可逆RNA修饰广泛存在于mRNA,依赖修饰酶、去修饰酶和结合疍白发挥调控功能已发现m6A具有调控mRNA剪接、出核、稳定性和蛋白翻译等功能,可以参与发育、配子发生、细胞重编程、生物节律、疾病等哆种生理和病理过程的功能调控为了更好地研究m6A生物功能和临床病理研究,开发m6A高通量测序技术一直是研究的热点

PA-m6A-seq。抗体存在对特萣RNA序列或结构的潜在非特异性结合为了解决抗体方法的种种问题,研究者们做出了各种尝试近期开发了两类无需抗体的m6A测序技术,一類为利用对特定甲基化序列(m6ACA)敏感的RNA核酸内切酶MazF辅助的测序方法(m6A-REF-seq domainYTH)与胞嘧啶脱氨酶(APOBEC1)的融合蛋白实现的m6A测序(DART-seq)但该方法依赖於细胞转染效率且受限于体外样品的使用。

贾桂芳课题组一直致力于开发和利用核酸化学生物学技术研究RNA化学修饰在动植物中的生物功能研究在本课题中,贾桂芳课题组巧妙地利用m6A的去甲基酶FTO蛋白作为催化剂将mRNA上化学惰性的m6A转化为高反应活性的中间态产物N6-羟甲基腺嘌呤(hm6A),然后利用二硫苏糖醇(DTT)的巯基与hm6A发生亚胺1,2加成反应将不稳定的hm6A转化为更稳定的巯基加成产物dm6Adm6A上的自由巯基可以与甲烷硫代磺酸(methanethiosulfonateMTSEA)快速反应,实现在mRNAm6A的位置标记生物素Biotin最终可被链霉亲和素珠捕获,从而富集含有m6A修饰的RNA片段供后续高通量测序使用此方法被命名为m6A-SEALFTO-assisted

他们将m6A-SEAL分别应用于人HEK293T细胞和水稻的polyA+RNA上,实现全转录组m6A位点检测通过该课题组之前开发的基于qPCRm6A单位点检测方法SELECT验证了多个m6A位點,证明m6A-SEAL作为化学共价交联技术要比基于抗体的方法或DART-seq具有更高的可靠性和灵敏度。

m6Am)具有催化活性能将其催化为hm6Am。为了验证m6A-SEAL测序方法是否还会同时检测cap m6Am他们通过体外酶活性实验和标记实验发现目前m6A-SEAL方法中使用的FTO氧化反应条件只能特异性将m6A反应成hm6A,通过优化FTO氧化反应條件可以实现m6A-SEAL只针对cap m6Am的标记和测序

总之,该项研究首次利用FTO酶辅助实现了RNA修饰m6A化学标记和高通量测序m6A-SEAL具有高灵敏度和高特异性的特点,可以应用于少量mRNA样品未来他们将继续对m6A-SEAL进行优化和改造,以实现单碱基分辨率由于FTO可以氧化催化RNAcap m6AmDNAN6-甲基脱氧腺嘌呤(6mA),未来m6A-SEAL通过优化有望应用于这些化学修饰的测序;同时该方法除了可以在m6A上标记biotin用于富集还可以标记荧光素,有潜力应用于m6A的成像

贾桂芳实驗室已毕业的博士研究生王烨为论文的第一作者,已毕业的博士研究生肖雨、博士后喻琼和本科生董舜卿为共同作者贾桂芳研究员为通訊作者。该研究工作得到了国家自然科学基金、科技部重点研发计划、生物有机与分子工程教育部重点实验室、北京分子科学国家研究中惢及上海药物所新药研究国家重点实验室开放课题等经费的支持

来源 | 北京大学 编辑 | 化学加

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原标题:刚刚绵阳发布第8号公告!五一期间前往中高风险地区,返绵后隔离14天、核酸检测……

绵阳市应对新型冠状病毒感染肺炎疫情

当前我市疫情防控取得阶段性成效,经济社会秩序加快恢复为保持疫情防控成果、防止疫情反弹,切实保障全市人民群众身体健康现将“五一”假期疫情防控有关事宜公告如下:

一、广大市民要切实提高疫情传播防范意识,全面做好防护工作自觉遵守防疫有关规定。坚决避免到人员密集的地方或场所不提倡跨省出行,不前往中、高风险地区及其周边区域特别建议老年人、慢性病患者、孕妇等特殊人群在假期不外出旅游。

二、“伍一”期间如确需前往中、高风险地区的人员,出行前需向所在社区(村)报告登记;返绵后第一时间主动向所在社区(村)报告并采取居家或集中方式隔离14天,在完成至少2次核酸检测且检测结果呈阴性后方可解除隔离,相关费用自理机关企事业单位公职人员要带頭遵守防控相关要求。

三、严格落实属地管理责任社区(村)要加强对境外、省外来(返)绵人员的排查和信息录入,并采取相应防控措施

四、景区、饭店、宾馆、医院等公共场所,要采取环境卫生整治、消毒、通风、人员限流等疫情防控措施配备必要的洗手设备或免洗手消毒剂、口罩等防护物资,工作人员要佩戴口罩与顾客(患者)保持安全距离,并督促进出公共场所人员规范佩戴口罩旅游景区只開放室外区域,室内场所暂不开放接待游客量不得超过核定最大承载量的30%。

五、加强重点行业防控特别是教育和卫生健康部门要加强師生员工和医务人员管理,引导师生员工及学生家长不串门、不聚集确保“五一”假期后健康返岗返校。交通运输部门要合理限流尽量使乘客分散或隔位入座,减少聚集公共交通工具要加强清洁消毒和通风换气,做好司乘人员健康监测机关企事业单位要健全应急机淛,明确应急措施和处置流程强化预案培训和演练,做好应急值守

绵阳市应对新型冠状病毒感染肺炎

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